6月29日上午，自治区工商联召开了全体干部职工大会，传达了《关于迅速贯彻落实张春贤书记重要指示的通知》和《关于和田县“6?28”群体聚集闹事案件的通报》，对工商联维稳工作进行了明确部署。自治区工商联要求全体干部职工要讲政治、识大局，态度鲜明，认真落实中央和自治区党委关于维护稳定工作的指示精神，充分认识新疆维护稳定工作的极端重要性和现实紧迫感，牢固树立稳定压倒一切的意识。全体干部职工纷纷表示，坚决拥护党中央和自治区对于维护新疆稳定所做的一系列指示精神及安排部署，做到立场坚定、态度鲜明，不信谣、不传谣，听从命令、服从指挥。
6月29日下午，自治区党委肖开提?依明常委召集工商联班子成员及分管部门负责人，进一步学习自治区党委关于维稳工作的一系列文件精神，对下一步做好各单位维稳工作提出了具体要求。根据肖开提?依明常委的要求，自治区工商联党组立即作出反应，进一步提出做好工作的七项措施：
一是立即起草下发紧急通知，要求各级工商联、各商会、各企业认真按照自治区党委的要求，坚决做好维护稳定工作。
二是与下派驻伊吾县的转服工作组建立每日情况互通制度，要求转服工作组与驻村警务室进行对接，确保维稳工作不留死角。
三是定于6月30日下午召开所属各类商会会长、秘书长座谈会，传达自治区党委维稳工作的文件精神，统一思想、统一认识，坚定发展信心，打消内地来疆投资民营企业家的恐慌疑虑，对做好商会及民营企业维稳工作提出明确要求和具体措施。
四是从7月1日开始，自治区工商联班子成员按照联系点分工，用一周左右的时间深入到驻乌地区商会、企业，开展宣传和排查工作，了解企业生产情况和员工思想动态，消除不稳定因素。
五是为集中精力做好维稳工作，原定于7月9日在乌鲁木齐召开的自治区工商联常委（扩大）会议，会期顺延。
六是要提高警惕，严密防范。6月29日（星期六）、6月30日（星期日）两天，工商联机关正常上班。工商联作为商会大厦的牵头单位，与街道办事处、社区建立协调工作机制，与商会大厦内的银行、公司等单位共同做好联防联保工作。
七是严格落实好 “7?5”等敏感时期值（带）班制度，带班领导、值班员、驾驶员24小时全天候在位。调整完善机关应急处置指挥机构，增强应急分队力量，制定应急预案，进行处置突发事件应急演练，保证商会大厦及干部职工的安全。